ميٿيلائيشن-اسپيس پي سي آر (ايم ايس پي) ​​کٽ

A-1 سانچو

■ ٽيمپليٽ تي مشتمل آھي پروٽين جون نجاستون يا Taq inhibitors.

template ٽيمپليٽ جي atاھڻ مڪمل نه آھي —— مناسب طور تي وatايو وatي atاھڻ جي درجه حرارت ۽ ڊگھو atاھڻ جو وقت.

■ ٽيمپليٽ خراب ڪرڻ the ٽيمپليٽ -يهر تيار ڪريو.

A-2 پرائمر

pri پرائمر جي ناقص معيار e پرائمر کي -يھر ھرايو.

■ پرائمر تباھي —— اعلي ڪنسنٽريشن پرائمر کي بچايو نن smallي مقدار ۾. گھڻن منجمد ۽ پگھلڻ کان پاسو ڪريو يا ڊگھي عرصي تائين 4 ° C cryopreserved.

pri پرائمر جي نامناسب ڊيزائن (مثال طور پرائمر جي ڊيگھ ڪافي ناھي ، پرائمر جي وچ ۾ imeھيل ڊيمر وغيره) -ري ڊيزائين پرائمر (پرائمر ڊيمر ۽ سيڪنڊري ساخت جي avoidاھڻ ​​کان پاسو ڪريو)

A-3 مگ²⁺توجه

■ مگ²⁺ ڪنسنٽريشن تمام گھٽ آهي ro خاص طور تي Mg و increaseايو²⁺ ڪنسنٽريشن: ايم پي کي وايو²⁺ 1 mM کان 3 mM تائين رد عمل جي ھڪڙي سلسلي سان ڪنسنٽريشن 0.5 mM جي وقفي سان و Mg ۾ و Mg Mg جو تعين ڪرڻ لاءِ²⁺ هر ٽيمپليٽ ۽ پرائمر لاءِ توجه.

A-4 انيلنگ جو گرمي پد

■ تيز annealing گرمي پد کي متاثر ڪري ٿو پرائمر ۽ ٽيمپليٽ جي پابند. -انيلنگ جي درجه حرارت کي گھٽايو ۽ حالت کي بهتر ڪريو 2 ° C جي درجه بندي سان.

A-5 وensionائڻ جو وقت

■ مختصر توسيع وقت extension و extensionائڻ جو وقت وايو.

Phenomena: منفي نمونا پڻ ڏيکارين ٿا ٽارگيٽ تسلسل بينڊ.

PCR جي A-1 آلودگي

target ٽارگيٽ تسلسل يا وlائڻ وارين شين جي پار آلودگي fully احتياط سان پائپ نه ڪيو و targetي ٽارگيٽ تسلسل وارو نمونو منفي نموني ۾ يا انھن کي اrليو سينٽرفيوج ٽيوب مان. ريجينٽس يا سامان پاڻمرادو beھيل ھئڻ گھرجي موجوده نيوڪليڪ ايسڊز کي ختم ڪرڻ لاءِ ، ۽ آلودگيءَ جو وجود منفي ڪنٽرول تجربن ذريعي طئي ٿيڻ گھرجي.

■ Reagent contamination liAliquot reagents ۽ اسٽور گھٽ درجه حرارت تي.

A-2 وزيراعظمr

■ مگ²⁺ ڪنسنٽريشن تمام گھٽ آهي ro خاص طور تي Mg و increaseايو²⁺ ڪنسنٽريشن: ايم پي کي وايو²⁺ 1 mM کان 3 mM تائين رد عمل جي ھڪڙي سلسلي سان ڪنسنٽريشن 0.5 mM جي وقفي سان و Mg ۾ و Mg Mg جو تعين ڪرڻ لاءِ²⁺ هر ٽيمپليٽ ۽ پرائمر لاءِ توجه.

■ نامناسب پرائمر ڊيزائن ، ۽ ٽارگيٽ تسلسل ۾ ھومولوجي آھي غير ھدفاتي تسلسل سان. -designيهر ڊيزائين ڪرڻ وارا پرائمر.

Phenomena: PCR amplification bands متضاد آھن متوقع سائيز سان ، يا ته وڏا يا نن ،ا ، يا ڪڏهن ڪڏهن specificئي مخصوص امپليفيشن بينڊ ۽ غير مخصوص امپليفيشن بينڊ.

A-1 پرائمر

pri غريب پرائمر جي خاصيت

-designيهر ڊيزائين ڪرڻ وارو پرائمر.

■ پرائمر جو ڪنسنٽريشن تمام گھڻو آھي ro مناسب طور تي وatايو وatي ڊيناتريشن جي درجه حرارت ۽ ڊگھو ڪرڻ وارو وقت.

A-2 مگ²⁺ توجه

Mg مگ²⁺ ڪنسنٽريشن تمام گھڻي آھي —— خاص طور تي Mg2+ ڪنسنٽريشن گھٽ ڪريو: Mg کي وايو²⁺ 1 mM کان 3 mM تائين رد عمل جي ھڪڙي سلسلي سان ڪنسنٽريشن 0.5 mM جي وقفي سان و Mg ۾ و Mg Mg جو تعين ڪرڻ لاءِ²⁺ هر ٽيمپليٽ ۽ پرائمر لاءِ توجه.

A-3 Thermostable polymerase

en ضرورت کان وzyيڪ انزائم جي مقدار en گھٽايو اينزيم جي مقدار کي مناسب طور تي 0.5 U جي وقفي تي.

A-4 انيلنگ جو گرمي پد

■ annealing گرمي پد تمام گھٽ آهي —— مناسب طور annealing گرمي پد و orائڻ يا adoptه-اسٽيج annealing طريقو اپنائڻ.

A-5 PCR سائيڪلون

many تمام گھڻا PCR چڪر PC PCR سائيڪلن جو تعداد گھٽايو.

A-1 پرائمرoor ناقص خاصيت the پرائمر کي -يهر ڊيزائين ڪرڻ ، پرائمر جي پوزيشن ۽ ڊيگھ تبديل ڪرڻ ان جي خاصيت و enhanceائڻ لاءِ يا نسٽ ٿيل PCR انجام ڏيو.

A-2 سانچو DNA

template ٽيمپليٽ خالص ناهي the ٽيمپليٽ کي صاف ڪريو يا ڊي اين اي ڪ purو صاف ڪرڻ جي ڪٽس سان.

A-3 مگ²⁺ توجه

—— ايم جي²⁺ ڪنسنٽريشن تمام گھڻي آھي Mg خاص طور تي Mg گھٽايو²⁺ ڪنسنٽريشن: ايم پي کي وايو²⁺ 1 mM کان 3 mM تائين رد عمل جي ھڪڙي سلسلي سان ڪنسنٽريشن 0.5 mM جي وقفي سان و Mg ۾ و Mg Mg جو تعين ڪرڻ لاءِ²⁺ هر ٽيمپليٽ ۽ پرائمر لاءِ توجه.

A-4 dNTP

- ڊي اين ٽي پيز جو ڪنسنٽريشن تمام گھڻو آھي - ڊي اين ٽي پي جو ڪنسنٽريشن مناسب طور تي گھٽ ڪريو

A-5 انيلنگ جو گرمي پد

oo تمام گھٽ annealing گرمي پد rop مناسب طور annealing گرمي پد ۾ اضافو

A-6 سائيڪلون

many تمام گھڻا چڪر cycle سائيڪل نمبر کي وايو

پهريون قدم آهي مناسب پوليميرس چونڊڻ جو. باقائده Taq پوليميرس 3'-5 'exonuclease سرگرمي جي کوٽ جي ڪري پروف ريڊ نٿو ٿي سگھي ، ۽ بي ترتيب ٽڪرن جي توسيع ڪارڪردگيءَ کي تمام گھٽ ڪندو. ان ڪري ، باقاعده Taq polymerase مؤثر طريقي سان ٽارگيٽ ٽڪرن کي وlائي نٿو سگھي 5 kb کان وڏو. Taq polymerase خاص ترميم سان يا highيو اعليٰ مخلص پوليمريز چونڊيو و beي ته جيئن وا extensionاري جي ڪارڪردگيءَ کي بھتر ڪري سگھجي ۽ ڊگھي ٽڪرا وlائڻ جي ضرورتن کي پورو ڪيو وي. ان کان علاوه ، ڊگھن ٽڪرن جي واl ويجھ لاءِ پڻ ضرورت آھي پرائمر ڊيزائن جي مناسب ترتيب ، ڊيناتوريشن ٽائيم ، ايڪسٽينشن ٽائيم ، بفر پي اي، ، وغيره. ٽيمپليٽ جي نقصان کي روڪڻ لاءِ ، 94 ° C تي atاھڻ جو وقت گھٽايو و 30ي 30 سيڪنڊ يا گھٽ في چڪر ۾ ، ۽ وقت و temperatureائڻ جو وقت 94 ° C تائين و ampڻ کان ا should 1 منٽ کان گھٽ ھجڻ گھرجي. ان کان علاوه ، و extensionائڻ جو گرمي پد تقريبا 68 68 ° C تي ۽ و extensionائڻ جو وقت kاھڻ 1 kb/منٽ جي شرح مطابق ڊگھي ٽڪرن جي اثرائتي ور ensure کي يقيني بڻائي سگھي ٿو.

پي سي آر وlائڻ جي غلطي جي شرح کي گھٽ ڪري سگھجي ٿو مختلف ڊي اين اي پوليميرس استعمال ڪري و highيڪ ايمانداري سان. ا allا تائين مليل س Taني طاق ڊي اين اي پوليميرسز مان ، پي ايف يو انزائم وٽ گھٽ ۾ گھٽ غلطي جي شرح ۽ س highest کان و fيڪ ايمانداري آھي (ڏسو جدول ڏسو). انزائم جي چونڊ کان علاوه ، محقق و PCيڪ گھٽ ڪري سگھن ٿا PCR ميوٽيشن جي شرح کي بهتر ڪندي رد عمل جي حالتن کي ، بشمول بفر جي جوڙجڪ کي بهتر ڪرڻ ، ٿرموسٽبل پوليميرز جي توسيع ۽ PCR سائيڪل نمبر کي بھتر ڪرڻ.